В отделение госпитализируют больных: а) с инфекционными  болезнями; б) с неустановленным диагнозом; в) находившихся в контакте с больными особо опасными инфекциями. Для предупреждения распространения инфекционных заболеваний проводится изоляция больных в инфекционный стационар по клиническим и эпидемиологическим показаниям. В инфекционном отделении осуществляется не только полноценное лечение больного, но и надежная его изоляция, обеспечивающая прекращение дальнейшего распространения инфекции. Основное требование, предъявляемое к инфекционному отделению  — защита от внутрибольничного заражения больных и медперсонала.

В отделении оказывается квалифицированная помощь  детям любого возраста и взрослым с острой и хронической инфекционной патологией (ОРВИ, острые кишечные инфекции различной этиологии, острые и хронические вирусные гепатиты, гнойные ангины, клещевые инфекции, ВИЧ инфекция, паразитарные инвазии и т. д.). При необходимости дальнейшее амбулаторное наблюдение  и дообследование проводится в кабинете инфекционных заболеваний  поликлиники МСЧ 128 врачом – инфекционистом.